Olha só Emerson... é bem mais fácil que parece:
depois de inserir o objeto ShockwaveFlash em seu projeto, selecione-o e na janela de propriedades localize a opção WMode, depois disso digite Transparent e salve o seu projeto.
agora quando você rodar o seu programa o fundo da animação vai estar transparente.
blz... quanlquer coisa posta aí pra galera te ajudar.
abraços,
Luciano