Siga as instruções abaixo:

1.: Coloque seu programa na pasta auto-iniciar:

Obs.: No windows XP ela está localizada em: C:Documents and SettingsAll UsersMenu

IniciarProgramasInicializar.

O Diretório é salvo em:
' [HKEY_CURRENT_USERSoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionExplorerShell Folders]
Startup="%USERPROFILE%Menu IniciarProgramasInicializar"
'
[HKEY_CURRENT_USERSoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionExplorerUser Shell Folders]
Startup="%USERPROFILE%Menu IniciarProgramasInicializar"
' [HKEY_LOCAL_MACHINESoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionexplorerUser Shell Folders]
"Common Startup"="%USERPROFILE%Menu IniciarProgramasInicializar"
' [HKEY_LOCAL_MACHINESoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionexplorerShell Folders]
"Common Startup"="%USERPROFILE%Menu IniciarProgramasInicializar"

2.: Encontre o arquivo "Win.ini" na pasta do windows;
Abra o arquivos e escreva os parâmetros:

Win.ini

[windows]
load=seu programa.exe
run=seu programa.exe

3.: Encontre o arquivo "System.ini" na pasta do windows;
Abra o arquivo e escreva os parâmetros:

system.ini

[windows]
load=seu programa.exe
run=seu programa.exe

4.: Escreva o arquivo "winstart.bat" no diretório do windows

Obs.: Este comando é opcional, você pode criar esse bat com os comandos que quiser e ele será

executado no início.

5.: Abra o regedit

[HKEY_LOCAL_MACHINESoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionRunServices]
"qualquercoisa"="caminhoseu programa.exe"

[HKEY_LOCAL_MACHINESoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionRunServicesOnce]
"qualquercoisa"="caminhoseu programa.exe"

[HKEY_LOCAL_MACHINESoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionRun]
"qualquercoisa"="caminhoseu programa.exe"

[HKEY_LOCAL_MACHINESoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionRunOnce]
"qualquercoisa"="caminhoseu programa.exe"

[HKEY_CURRENT_USERSoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionRun]
"qualquercoisa"="caminhoseu programa.exe"

[HKEY_CURRENT_USERSoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionRunOnce]
"qualquercoisa"="caminhoseu programa.exe"

[HKEY_CURRENT_USERSoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionRunServices]
"qualquercoisa"="caminhoseu programa.exe"

6.: Componente Active-X
[HKEY_LOCAL_MACHINESoftwareMicrosoftActive SetupInstalled ComponentsKeyName]
StubPath="caminhoseu programa.exe"

Acredite ou não, isso inicia o arquivo.exe ANTES do shell (explorer.exe) e de qualquer outro
programa iniciado pelas chaves RUN

7.: Informação interessante
[HKEY_LOCAL_MACHINESoftwareCLASSESShellScrap] at ="Scrap object"
"NeverShowExt"=""
A chave NeverShowExt têm a função de ESCONDER a extensão real de arquivos SHS.
Isso significa que se você renomear um arquivo como "Garota.jpg.shs" ele mostra apenas

"Garota.jpg" em todos os programas, incluido o Windows Explorer. Se você acrescentar novos tipos

de extensão, mais será escondido."

'Este post é uma adaptação de colunas relacionadas à este assunto.